docs(mvp): update RAG docs for py-rag extraction

- rewrite RAG architecture doc for py-rag service contract mapping, ingest and rebuild ops
- refresh observability/trace doc for post-L0 single-attempt semantics
- add py-rag chain exploration note; mark superseded Milvus/L0 notes with status banners
- close ISS-017 (superseded by L0 sinking); mark knowledge_domain table orphaned
- refresh architecture/mvp/engineering indexes

mvp/tables/知识域表-knowledge_domain.md

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 # 知识域表：knowledge_domain
 
-**状态**：当前表  
+**状态**：孤儿表（2026-09-29 RAG 抽离后无写入方）  
 **来源**：`V009__add_knowledge_domain.sql`、`KnowledgeDomain`
 
+> **2026-09-29 变更**：本表的写入方 `KnowledgeDomainService` 已随 RAG 模块抽离删除
+> （L0 domain 分析下沉 py-rag）。表结构由 Flyway 保留（`ddl-auto: validate`），当前无读写方，
+> 待后续迁移清理。历史数据仅供追溯。
+
 ## 定位
 
 `knowledge_domain` 保存知识库领域级元数据，为 RAG backend 的 domain hint、检索选择和可观测性提供基础信息；它不是 Agent-facing Tool contract。