docs: 重构文档结构，分离学习笔记和 MVP 架构设计

**变更概述：**
- 将 MVP 架构设计文档独立到项目根目录 `mvp/`
- 整理 `docs/` 为纯学习和分析文档目录
- 按类型分类：learning（学习）、analysis（分析）、reports（报告）、guides（指南）

**目录结构：**
```
mvp/                          # MVP 架构设计（独立）
├── README.md                 # 数据库设计总览
├── architecture/             # 架构文档
│   ├── agent-architecture-mvp.md
│   ├── implementation-plan.md
│   └── ...
└── tables/                   # 数据表设计

docs/                         # 学习和分析文档
├── learning/                 # 学习笔记（00-08 编号）
├── analysis/                 # 分析笔记 + 重构计划
├── reports/                  # 临时报告
└── guides/                   # 指南文档
```

**详细变更：**
- docs/README.md → mvp/README.md（数据库设计入口）
- docs/architecture/ → mvp/architecture/（架构设计）
- docs/tables/ → mvp/tables/（数据表设计）
- docs/学习笔记-*.md → docs/learning/07-*.md, 08-*.md
- docs/项目学习路径.md → docs/learning/00-*.md
- docs/功能分析报告.md → docs/analysis/
- docs/修复报告-*.md → docs/reports/
- docs/日志配置*.md → docs/guides/ 或 docs/reports/
- docs/design/ → docs/analysis/（问题分析和重构计划）

docs/INDEX.md

@@ -1,81 +1,108 @@
-# 数据库设计文档索引
+# 文档索引
 
-## 📂 文档结构
+## 📂 目录结构
 
 ```
 docs/
-├── README.md                              # 总览（推荐从这里开始）
-├── database-design.md                     # 总览（同 README.md）
+├── README.md                              # 项目文档总览
+├── INDEX.md                               # 本索引文件
 │
-├── tables/                                # 表设计详细文档
-│   ├── diagnosis_record.md                # 诊断记录表（核心）
-│   ├── case_library.md                    # 案例库表
-│   └── api_document.md                    # 文档元数据表
+├── learning/                              # 📚 学习笔记（个人学习理解）
+│   ├── 00-项目学习路径.md
+│   ├── 01~08-*.md                         # 按学习顺序编号
+│   └── README.md
 │
-└── architecture/                          # 架构设计文档
-    ├── agent-architecture-mvp.md          # ⭐ Agent 架构 MVP 精简版
-    ├── agent-architecture.md              # Agent 架构完整版（含生产级扩展）
-    ├── session-management.md              # 会话管理设计
-    └── implementation-plan.md             # 实施规划
+├── analysis/                              # 🔍 分析笔记（代码/问题分析）
+│   ├── essence-report-*.md
+│   ├── explore-report.md
+│   ├── chunking-issues-analysis.md
+│   └── 功能分析报告.md
+│
+├── reports/                               # 📝 临时报告（修复/验证报告）
+│   ├── 修复报告-*.md
+│   ├── 验证报告-*.md
+│   └── 日志配置完成总结.md
+│
+└── guides/                                # 📖 指南文档
+    └── 日志配置与分析指南.md
 ```
 
+**⚠️ 注意：MVP 架构设计文档已移至项目根目录 `../mvp/`**
+
+查看 [mvp/README.md](../mvp/README.md) 了解 MVP 架构、数据库设计、实施计划等。
+
 ---
 
 ## 🚀 快速导航
 
+### 我是新人/学习者
+1. [项目学习路径](learning/00-项目学习路径.md) - 从这里开始
+2. [learning/README.md](learning/README.md) - 学习笔记索引
+3. 按编号顺序阅读 `learning/` 目录下的文档
+
 ### 我是开发者
-1. [总览](README.md) - 了解整体设计
-2. [diagnosis_record](tables/diagnosis_record.md) - 核心业务表
-3. [实施规划](architecture/implementation-plan.md) - 开发计划
+👉 **MVP 架构设计文档已移至 `../mvp/`**
 
-### 我是运维
-1. [总览](README.md) - 了解表结构
-2. [实施规划](architecture/implementation-plan.md) - 部署检查清单
+请查看 [mvp/README.md](../mvp/README.md) 了解：
+- MVP 架构设计
+- 数据库设计和表结构
+- 实施规划（Phase 1/2/3）
+- 会话管理设计
 
-### 我是产品
-1. [总览](README.md) - 了解系统定位
-2. [会话管理](architecture/session-management.md) - 了解用户交互流程
+### 我要查看分析报告
+1. [分析笔记目录](analysis/) - 代码分析和问题分析
+2. [临时报告目录](reports/) - 修复和验证报告
 
 ---
 
-## 📋 表清单
+## 📚 学习笔记 (learning/)
 
-| 表名 | 优先级 | 文档 | 说明 |
-|------|--------|------|------|
-| diagnosis_record | P0 | [查看](tables/diagnosis_record.md) | 诊断记录（核心） |
-| case_library | P0 | [查看](tables/case_library.md) | 案例库 |
-| api_document | P0 | [查看](tables/api_document.md) | 文档元数据 |
+按学习顺序编号，建议按顺序阅读：
+
+1. [00-项目学习路径](learning/00-项目学习路径.md)
+2. [01-AI-Ops-核心设计-Essence报告](learning/01-AI-Ops-核心设计-Essence报告.md)
+3. [02-outputKey-深度解析](learning/02-outputKey-深度解析.md)
+4. [03-核心疑问解答](learning/03-核心疑问解答.md)
+5. [04-RAG-分块策略-Essence报告](learning/04-RAG-分块策略-Essence报告.md)
+6. [05-文件上传自动索引-Essence报告](learning/05-文件上传自动索引-Essence报告.md)
+7. [06-RAG查询流程-Essence报告](learning/06-RAG查询流程-Essence报告.md)
+8. [07-Tool定义方式对比与优化](learning/07-Tool定义方式对比与优化.md)
+9. [08-MethodToolCallback-vs-ToolCallingManager深度分析](learning/08-MethodToolCallback-vs-ToolCallingManager深度分析.md)
 
 ---
 
-## 📖 阅读建议
+## 🔍 分析笔记 (analysis/)
 
-### 第一次阅读
-```
-1. README.md（10分钟）
-   - 了解设计原则
-   - 了解表关系
-   
-2. diagnosis_record.md（15分钟）
-   - 核心表设计
-   - 字段泛化设计
-   
-3. implementation-plan.md（5分钟）
-   - 分阶段实施计划
-```
+代码分析和问题分析文档：
 
-### 深入理解
-```
-- case_library.md - 案例推荐机制
-- api_document.md - 文档管理设计
-- session-management.md - 会话管理机制
-```
+- [essence-report-rag.md](analysis/essence-report-rag.md)
+- [essence-report-rag-chunking.md](analysis/essence-report-rag-chunking.md)
+- [explore-report.md](analysis/explore-report.md)
+- [chunking-issues-analysis.md](analysis/chunking-issues-analysis.md)
+- [功能分析报告.md](analysis/功能分析报告.md)
+
+---
+
+## 📝 临时报告 (reports/)
+
+修复报告和验证报告：
+
+- [修复报告-多轮对话时间查询缓存问题](reports/修复报告-多轮对话时间查询缓存问题.md)
+- [验证报告-时间查询问题](reports/验证报告-时间查询问题.md)
+- [日志配置完成总结](reports/日志配置完成总结.md)
+
+---
+
+## 📖 指南文档 (guides/)
+
+- [日志配置与分析指南](guides/日志配置与分析指南.md)
 
 ---
 
 ## 🔄 文档维护
 
-- 原完整文档已备份：`database-design-backup-20240622.md`
-- 每个表的详细设计在 `tables/` 目录
-- 架构设计在 `architecture/` 目录
-- 修改表结构时，同步更新对应 Markdown
+- **学习笔记** 放在 `learning/` 目录，按编号顺序命名
+- **分析笔记** 放在 `analysis/` 目录
+- **临时报告** 放在 `reports/` 目录
+- **指南文档** 放在 `guides/` 目录
+- **MVP 架构设计** 已移至项目根目录 `../mvp/`（包含架构、数据库、实施计划）