feat(harness,rag): dual LLM audit fields, run conclusion, and hybrid quality

Persist provider reasoning and assistant text separately on agent_reasoning_audit
(DeepSeekAssistantMessage path), extract diagnosis_run.conclusion, enrich RAG
tool audit (step_id/query/qualityScore), gate empty mysql tools, drop devtools,
and align MVP docs after live E2E verification.

devflow/projects/2026-07-28-rag-quality-score-unify/brief.md

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+# Brief: rag-quality-score-unify
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+## Background
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+真 BM25 hybrid（dense + BM25 + RRF）已上线，但后处理仍把 hybrid 结果伪装成 L2 做 `normalizeL2`，并用 L0 domain/entity/keyword contains 加分改序。排序权威与质量闸门分裂，词面信号被 BM25 与后处理双重计分。
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+## Goals
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+- 一级 `scoreLabel` 仅 `dense` | `hybrid`
+- 唯一 `toQualityScore`；后处理 label-agnostic
+- 排序主序 = 检索 `originalRank`；去掉关键词 boost 改序
+- hybrid quality = 本轮 rank 纯映射（不做 max(rank, denseSim)、不为闸门回填 L2）
+- 保留 `mode=dense` 作同库召回对照；线上默认 hybrid
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+## Scope
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+内部 RAG：store 发射、normalizer、evidence post-process、单测、架构文档 §6。
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+## Non-goals
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+精排 / query rewrite / 邻块、schema rebuild、改 Agent ACI 字段名、删除 dense 对照 mode。